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1978年10月绥宁县林业科学研究所采种队在进行林木采种和相关调查中,在赤板村源头山发现全球少有的古老孑遗植物长苞铁杉林群落,在全省全国影响很大,引起政府及林业部门的广泛重视; 1980年6月,省、市、县19个单位联合对黄桑天然次生林进行综合科学考察,按当时国家林业部、省林业厅颁布的保护分类标准,发现国家一类保护动物2种,二类8种,三类7种,省级保护的10种;国家一类保护植物1种,二类7种,三类13种,省级保护的21种(均为当时标准),编写了《黄桑天然次生林考察报告》。
1982年4月3日湖南省人民政府湘政发[1982]29号文《关于保护稀有珍贵动植物的通知》,正式批准成立绥宁县黄桑省级自然保护区;1984年6月根据湖南省林业厅、省编制委员会、省财政厅、省劳动人事厅以湘林森[84]10号、湘编[84]43号联合下文,正式成立黄桑自然保护区管理所和动植物综合试验站,保护区管理所及试验站均设黄桑乡九溪冲。保护区范围为黄桑坪苗族乡磨石、潭泥、万博max体育官网、赤板、老团、兰家、坪溪、界溪等8个村、长铺苗族乡安阳山村所辖。为了明确保护区的经营管理范围,1984年8月由绥宁县人大、县政府、县农委的主要负责人带队,在黄桑坪苗族乡、寨市乡、长铺子乡和有关村主任等相关人员参与下,经过2个多月的踏勘协商,实地确定了该保护区的山场范围,并及时与保护山场相关村组签定了加强保护管理的协议,保护区总面积12590公顷。为切实保护好该片天然次生林,保护好区内森林生态系统及其栖息的生物物种资源,拯救濒于灭绝的物种,湖南省人民政府决定向国务院申请将该省级保护区升格为国家级自然保护区。
2005年7月23日,国务院以国办发2005[40]号文件,正式批准黄桑自然保护区晋升为国家级。